Fazıl Say, 14 Ocak 1970 tarihinde Ankara'da müzikle iç içe bir ailede dünyaya geldi. Babası Ahmet Say, bir yazar ve müzikologdur. Fazıl Say'ın müzikle tanışması oldukça erken bir yaşta gerçekleşti. Üç yaşındayken obuacı Ali Kemal Kaya ile ritmik jimnastik ve işitme alıştırmalarına başladı. Bir yıl sonra, Mithat Fenmen'den aldığı piyano dersleriyle müziğe olan tutkusu daha da güçlendi. Mithat Fenmen ile sekiz yıl süren eğitim süreci, piyano, solfej ve teorinin yanı sıra besteciliğe olan ilgisini de arttırdı.
1982 yılında Mithat Fenmen'in vefatının ardından Ankara Devlet Konservatuvarı'na giren Fazıl Say, hızlandırılmış yoğun eğitim programı kapsamında Kamuran Gündemir ile piyano, İlhan Baran ile kompozisyon çalıştı. Gündemir'in yorum kavrayışı gerektiren yapıtlar üzerindeki değerlendirmeleri ve İlhan Baran'ın teknik donanımları kazandırmaya yönelik çalışmaları, Say'ın müzikal gelişiminde önemli bir rol oynadı.
1991 yılında "Konser Piyanisti" diplomasını alan Fazıl Say, Almanya'ya giderek David Levine'in öğrencisi oldu. Levine, dünyaca ünlü bir Schubert yorumcusu olarak, Say'ın piyano tekniğini ve yorumunu şekillendirmede etkili oldu. Ayrıca, Say'ın bestecilik yeteneğini geliştirmesi için çeşitli çalışmalar yaptı.
1991 yılında Avrupa Piyano Yarışması'nda birinci olan Fazıl Say, bu başarısını New York'ta düzenlenen uluslararası yarışmada da dünya birinciliği elde ederek taçlandırdı. Bu başarılar, onun kariyerine yeni bir ivme kazandırdı ve uluslararası alanda tanınmaya başladı.
Fazıl Say, bestecilik kariyerine de büyük önem vermiştir. Yazdığı piyano eserlerini daha sonra orkestra eserlerine dönüştürmesiyle tanınır. Yaptığı besteler arasında piyano konçertoları, orkestra eserleri ve klasik müzikle modern cazın sentezlendiği eserler bulunmaktadır. Ayrıca, çağdaş müzik alanında da aktif bir şekilde çalışmalarını sürdürmektedir.
Müzik kariyerinin yanı sıra Fazıl Say, 1999 yılında "Uçak Notaları" adlı bir kitap yayınlamıştır. Bu kitap, müzik ansiklopedisi yayınları arasında yer almıştır.
Fazıl Say'ın albüm çalışmaları da oldukça geniştir. Wolfgang Amadeus Mozart'tan Igor Stravinsky'ye, Johann Sebastian Bach'tan Franz Liszt'e kadar pek çok ünlü bestecinin eserlerini kaydetmiş ve bu kayıtlar uluslararası alanda büyük beğeni toplamıştır.
Sanat kariyerindeki başarılarıyla birlikte Fazıl Say, birçok ödülün sahibi olmuştur. Avrupa Birliği Piyano Yarışması'nda kazandığı birincilik, Genç Konser Solistleri Yarışması'nda elde ettiği Avrupa ve dünya birincilikleri, Radio France/Beracasa Vakfı, Paul A. Fish Vakfı, Boston Metamorphosen Orkestrası, Maurice Clairmont Vakfı gibi prestijli ödüller, onun sanatındaki üstünlüğünü kanıtlar niteliktedir.
Fazıl Say, müziğin sınırlarını zorlayan, klasik müziği modern çağa taşıyan ve kendi tarzını yaratan bir sanatçı olarak dünya çapında tanınmaktadır.